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A-Modul "Molekularbiologie der Pflanzen"

Im A-Modul "Molekularbiologie der Pflanzen", 2. Semesterdrittel, werden aktuelle Inhalte pflanzenphysiologischer Forschung zusammen mit einer breiten Palette an modernen Arbeitsmethoden der Pflanzenphysiologie vermittelt. Die vier Kurswochen bieten zusammen mit der begleitenden Vorlesung "Molekularbiologie der Pflanzen" und dem A-Modul Seminar einen vertiefenden Einblick in verschiedene Gebiete dieses vielschichtigen und für die Pflanzenwissenschaften zentralen Faches. Zugleich sind die Versuche so ausgewählt, dass sie verschiedene Ebenen pflanzlicher Leistungen und experimentelle Herangehensweisen zu deren Bearbeitung beleuchten.
Als Versuchsthemen sind vorgesehen:

  1. Interaktionen im Chloroplasten
    Ebene: Interaktion und Lokalisation von Proteinen
    Protein-Protein-Interaktionen im Chloroplasten, untersucht mit Hilfe des „Yeast-two-Hybrid“ Systems, Lokalisation chloroplastidärer Proteine mit Hilfe von GFP-Fusionsproteinen.
  2. Grundlagen der Bioinformatik mittels Transcriptomanalyse (RNA-Seq)
    Ebene: Einführung in bioinformatisches Arbeiten mittels RNA-Sequenzierungsdaten
    Einführung und Grundlagen der Bioinformatik, Einführung in das Programmieren mit “R”, qualitative und quantitative Prozessierung und Auswertung von RNA-Sequenzierungsdaten, bioinformatische Datenanalyse, Einordnen bioinformatischer Daten in den biologischen Kontext
  3. Molekularbiologie Höherer Pflanzen
    Ebene: Gene und Genregulation
    Grundlagen der Molekularbiologie (Vektoren, Wirte, cDNAs, Sequenzuntersuchungen). Proteinchemische und enzymologische Analyse eines klonierten pflanzlichen Enzyms. Bakterielle Überexpression des pflanzlichen Proteins. Analyse der Genexpression in transgenen Pflanzen. Arabidopsis thaliana als Modell der molekularen Pflanzenphysiologie.
  4. Metall-Homöostase in Pflanzen
    Ebene: Identifizierung und Charakterisierung von T-DNA-Mutanten: Beziehung zwischen Genotyp und Phänotyp
    Genregulation (RNA- und cDNA-Präparation, Reverse Transkriptase-Polymerase-Kettenreaktion), Präparation von genomischer DNA, PCR, Mendelsche Regeln, Aufnahme von Metallen in Pflanzenzellen, enzymatische Analyse, natürliche Variation.

Aktuelle Angaben zum Block finden sich jeweils auch am "Schwarzen Brett" des Lehrstuhls für Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen, ND3 Nord.
 

A-Modul "Molekularbiologie der Pflanzen" Wintersemester 2024/25

Vorlesungs-Nr.: 190 085
(Seite 19 im A-Modulverzeichnis WiSe 24/25)
Titel: A-Modul "Molekularbiologie der Pflanzen"
Studiengänge: M.Sc, B.Sc., M.Ed.
Anmeldung: erfolgt zentral
Vorbesprechung Di, 08.10.2024, 11.00 – 12.00 Uhr, ND 3/34
Zur Vorbesprechung bitte die Grundmodulbescheinigung oder die vorläufige Bescheinigung und den Schein für die "Pflanzenphysiologischen Übungen" mitbringen.
Dauer des Blocks: 4 Wochen ganztägig
Beginn: Mo, 18.11.2024, 8.15 Uhr (ND 3/34)
Ende: Fr, 13.12.2024
Klausur: Fr, 20.12.2024, 9.00 - 11.00 Uhr (NDEF 06/398)
Vorlesungen: Di, Mi, Do, 8.30 - 9.30 Uhr, ND 3/34
Seminare: Freitags ab 8.30 Uhr in ND 3/34
Seminarplan, Literatur und Seminarbetreuer s. Aushang am Schwarzen Brett des Lehrstuhls bzw. Vorbesprechung
Name der Dozierenden: Krämer, Piotrowski, Dhar, Soltani,
Programm:
Dr. B. PietzenukWoche 1: 18. - 22.11.2024
"Seminare und Vorlesungen"
(Prof. Dr. Krämer, PD Dr. Piotrowski)
Dr. M. BernalWoche 2: 25. - 29.11.2024
"Metall-Homöostase in Pflanzen"
(Dr. O. Soltani)
PD. Dr. M. PiotrowskiWoche 3: 02. - 06.12.2024
"Molekularbiologie Höherer Pflanzen"
(PD. Dr. M. Piotrowski)
Prof. Dr. D. SchünemannWoche 4: 09. - 13.12. 2024
"Grundlagen der Bioinformatik"
(Dr. Yogeshwar Vikram Dhar)
Teilnehmerzahl:  16
Voraussetzung: Abschluss B.Sc., B.A., Grundmodulprüfung, Pflanzenphysiologische Übungen, Chemie-, Physikpraktikum
Credit Points 10
Die CP werden vergeben, wenn ein korrektes Protokoll eingereicht wurde, ein Seminarvortrag (15 Min.) erfolgreich gehalten und die Abschlussklausur (2 Std.) mit mind. 50% bese. Keine Benotung detanden wurds Moduls.

 

A-Modul "Moderne Pflanzenwissenschaften"

Die Studierenden führen aktuelle Versuche aus den Forschungsgebieten der beteiligten Arbeitsgruppen und Lehrstühle durch (Baginsky, Ebert, Grefen, Krämer, Piotrowski, Schünemann, Üstün). Zentrales Untersuchungsobjekt ist der Modellorganismus Höherer Pflanzen, Arabidopsis thaliana, mit dem molekulargenetische, physiologische, biochemische und zellbiologische Fragestellungen bearbeitet werden. Im Einzelnen werden folgende Themen behandelt: Das zentrale Dogma der Molekularbiologie, Anpassungen an Umweltbedingungen, Beziehung zwischen natürlicher genomischer Variation, molekularer Funktion, sichtbarem Phänotyp und Umweltbedingungen, Mechanismen des chloroplastidären Proteintransports, Proteintransport und Qualitätskotrolle über Autophagie und das Ubiquitin-Proteasome-System, Funktion posttranslationaler Modifikationen in der Regulation der Photosynthese, Membranproteine und deren Insertionswege, Zellwandbiosynthese und Glykosylierung von Membranproteinen und -lipiden.

A-Modul "Moderne Pflanzenwissenschaften" Wintersemester 2024/25

Vorlesungs-Nr.: 190 033
(Seite 23 im A-Modulverzeichnis WiSe 24/25)
Titel: A-Modul "Moderne Pflanzenwissenschaften"
Studiengänge: B.Sc
Anmeldung: erfolgt zentral
Vorbesprechung Mi, 09.10.2024, 10.00 Uhr, ND 5/63a
Dauer des Blocks: 4 Wochen ganztägig
Beginn: Mo, 13.01.2025, 8.15 Uhr (ND 3/34)
Ende: Fr, 08.02.2025
Name unserer Dozent/innen: Prof. Dr Krämer, PD Dr. Piotrowski, Dr. Soltani
Programm des LS "Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen"
Fr, 24. - Di, 28.01.2025
Thema: Gene function, reverse genetics and natural variation
Teilnehmerzahl:  12
Credit Points 10
Seminarvortrag (20 Min.), Führen eines Laborbuchs, Ergebnispräsentation / Abschlusskolloquium (Gruppenprüfung), korrektes Protokoll
 

Überblick

  • Laborfoto

MOODLE (BIO IV)

  • Moodle Kurs »Molekularbiologie der Pflanzen" (190085-WiSe23/24)« und "Moderne Pflanzenwissenschaften (190033-WiSe23/24)"
    Kursmaterial wie die Vorlesungsfolien liegen hier bereit. Das Passwort erfahren Sie von den Dozenten in der Vorlesung oder im Kurs. In der Regel werden Sie aber vom Kursleiter eingetragen.
    Zu Moodle
  • Hinweise zur Anmeldung
    Sie melden sich auf der Login-Seite mit Ihrem RUB-Benutzernamen und Passwort an.
    Wenn Sie zum ersten Mal Moodle besuchen, werden Sie aufgefordert Ihr Profil zu vervollständigen. Anschließend müssen Sie einer Zustimmungs-erklärung zustimmen. Danach loggen Sie sich wieder aus und wieder ein, um das typische Moodle-Startfenster zu erhalten.
    Oben rechts auf der Moodle-Start-Seite tippen Sie unter Kurssuche die Kursnummer »190085« ein. Der Kurs wird dann direkt darunter gelistet. Der Link führt zu einer Seite, auf der das Passwort eingegeben werden muss.
    Wenn Sie sich einmal angemeldet haben, erscheint der Kurs zukünftig auf Ihrer Moodle Startseite.